Detalles de la búsqueda
1.
teemi: An open-source literate programming approach for iterative design-build-test-learn cycles in bioengineering.
PLoS Comput Biol
; 20(3): e1011929, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38457467
2.
CRI-SPA: a high-throughput method for systematic genetic editing of yeast libraries.
Nucleic Acids Res
; 51(17): e91, 2023 09 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37572348
3.
Engineering of Pseudomonas putida for accelerated co-utilization of glucose and cellobiose yields aerobic overproduction of pyruvate explained by an upgraded metabolic model.
Metab Eng
; 75: 29-46, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36343876
4.
Laboratory evolution reveals general and specific tolerance mechanisms for commodity chemicals.
Metab Eng
; 76: 179-192, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36738854
5.
Engineering precursor supply for the high-level production of ergothioneine in Saccharomyces cerevisiae.
Metab Eng
; 70: 129-142, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35085780
6.
Emergence of Phenotypically Distinct Subpopulations Is a Factor in Adaptation of Recombinant Saccharomyces cerevisiae under Glucose-Limited Conditions.
Appl Environ Microbiol
; 88(7): e0230721, 2022 04 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35297727
7.
Genome-scale metabolic modeling of P. thermoglucosidasius NCIMB 11955 reveals metabolic bottlenecks in anaerobic metabolism.
Metab Eng
; 65: 123-134, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33753231
8.
Fluctuations in glucose availability prevent global proteome changes and physiological transition during prolonged chemostat cultivations of Saccharomyces cerevisiae.
Biotechnol Bioeng
; 117(7): 2074-2088, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32277712
9.
Combined In-Cell NMR and Simulation Approach to Probe Redox-Dependent Pathway Control.
Anal Chem
; 91(8): 5395-5402, 2019 04 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30896922
10.
MARSI: metabolite analogues for rational strain improvement.
Bioinformatics
; 34(13): 2319-2321, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29949953
11.
Integration of enzymatic data in Bacillus subtilis genome-scale metabolic model improves phenotype predictions and enables in silico design of poly-γ-glutamic acid production strains.
Microb Cell Fact
; 18(1): 3, 2019 Jan 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30626384
12.
Escher: A Web Application for Building, Sharing, and Embedding Data-Rich Visualizations of Biological Pathways.
PLoS Comput Biol
; 11(8): e1004321, 2015 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26313928
13.
Evolution reveals a glutathione-dependent mechanism of 3-hydroxypropionic acid tolerance.
Metab Eng
; 26: 57-66, 2014 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25263954
14.
Probing efficient microbial CO2 utilisation through metabolic and process modelling.
Microb Biotechnol
; 17(2): e14414, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38380934
15.
Bottom-up parameterization of enzyme rate constants: Reconciling inconsistent data.
Metab Eng Commun
; 18: e00234, 2024 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38711578
16.
Simultaneous application of enzyme and thermodynamic constraints to metabolic models using an updated Python implementation of GECKO.
Microbiol Spectr
; 11(6): e0170523, 2023 Dec 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37931133
17.
A Genome-Scale Metabolic Model of Methanoperedens nitroreducens: Assessing Bioenergetics and Thermodynamic Feasibility.
Metabolites
; 12(4)2022 Mar 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35448501
18.
Reconstruction of a catalogue of genome-scale metabolic models with enzymatic constraints using GECKO 2.0.
Nat Commun
; 13(1): 3766, 2022 06 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35773252
19.
Whole-cell modeling in yeast predicts compartment-specific proteome constraints that drive metabolic strategies.
Nat Commun
; 13(1): 801, 2022 02 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35145105
20.
Do genome-scale models need exact solvers or clearer standards?
Mol Syst Biol
; 11(10): 831, 2015 Oct 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26467284